ไม่ว่าจะเป็นเรื่องใดก็มีความเสี่ยงด้วยกันทั้งนั้น แม้ว่าจะเป็นในทางการแพทย์ก็ตาม และในการขุดมดลูกก็เช่นเดียวกัน สามารถเกิดภาวะแทรกซ้อนหรือผลกระทบเช่นกัน คือ
- ภาวะอาการแทรกซ้อนจากยาชา หรือ การวางยาสลบ – อาการแทรกซ้อนจากกรณีนี้ก็อาจเกิดได้จากการแพ้ยา ซึ่งถ้าผู้ป่วยมีอาการแพ้มากหรือเป็นมาก ก็มีโอกาสที่จะหยุดหายใจได้
- การเสียเลือดมาก – ในกรณีนี้ไม่ได้เกิดจากการขูดมดลูก แต่เกิดจากการเป็นโรคมะเร็งเยื่อบุโพรงมดลูก (มะเร็งมดลูก) , มะเร็งปากมดลูก , หรือในผู้ที่รับประทานยาสลายลิ่มเลือด ดังนั้นในผู้หญิงที่รับประทานยาสลายลิ่มเลือดควรงดรับประทานยา 1-2 สัปดาห์ก่อนมาขูดมดลูก
- การอักเสบ และการติดเชื้อ – ในการขูดมดลูกมีโอกาสที่จะติดเชื้อโรคที่ไม่สะอาดได้ ไม่ว่าจะเป็นการขูดมดลูกจากการทำแท้งเถื่อน หรือในการขูดมดลูกโดยแพทย์นั้นก็มีโอกาสเกิดอาการมดลูกอักเสบ มดลูกติเชื้อได้ เพราะลิ่มเลือดที่ยังหลงเหลืออยู่ภายในของมดลูก ถือเป็นอาหารห้าดาวให้กับเชื้อโรคเลย
- มดลูกทะลุ – ในกรณีนี้เกิดจากการที่มีผนังมดลูกบาง เล็ก หรือผนังมดลูกอักเสบ ติดเชื้ออยู่
- มดลูกตีบตัน – ในการขูดมดลูกอย่างรุนแรงอาจทำให้เยื่อบุโพรงมดลูกถูกทำลายลงไปได้ จึงเป็นเหตุให้มดลูกเกิดการเข้ามาติดกัน จนเกิดเป็นมดลูกตีบตันได้ ซึ่งเป็นเหตุให้ไม่มีประจำเดือนและไม่สามารถมีลูกได้